3)第一百八十三章 老裘,你的病有救啦!()_荒木泽代走进不科学
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  计文稿之一,也算是个比较权威的推论了。

  870万对比200万。

  因此在青苔之中发现某种甚至多种微生物的存在,徐云真的一点儿都不惊讶。

  随后他沉思片刻,对裘生道:

  “老裘,先做16S相似度检测吧。”

  裘生点点头,飞快的带上套...手套,说道:

  “行,我立马就做。”

  一般来说。

  如果是培养皿培育出的菌株,检测或者对比的难度往往都不高。

  但对象若是自然界富集的样本,操作起来就比较麻烦了。

  徐云所说的16S相似度检测,指的是核糖体小亚基的RNA组分检测。

  也就是16SrRNA。

  这部分长度大约1500nt,不同物种略有差异,算是目前主流的九大新物检测步骤之一。

  五分钟后。

  裘生抬起头,对徐云道:

  “老徐,准备好了,引物你觉得用啥?”

  徐云想了想,很快道:

  “1492R吧。”

  “好嘞!”

  半个小时后。

  裘生抬起头,打了个响指:

  “搞定,扩出来了,BLAST的密匙你有吧?”

  徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮,随后走到操作台边,噼里啪啦的输了一大串密匙。

  做过新种检测的同学应该都知道。

  16S相似度检测的界限其实有些模糊,因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。

  比如有的是97%,有的是99%。

  只是在通常情况下。

  相似度超过97%的,就可以认为是一个物种。

  相似度低于97%的,就可以认为是不同物种,进行下一阶段检测。

  不过就是这样一种不太精细的检测手段,却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎:

  大部分样本在经过检测之后,都会发现相似度在%以上,与其他某某微生物是同一物种。

  总而言之。

  这项技术在定属方面还是靠谱的。

  又过了一会儿。

  裘生一脸惊喜的抬起头,声音骤然拔高了几分:

  “老徐,相似度%,%!!”

  “毫无疑问,这是一类新物!”

  徐云认真的看了他一眼,确认道:

  “只有一种新物吗?”

  “没错,只有一种!”

  徐云若有所思的点点头,又道:

  “那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。”

  众所周知。

  新物鉴定一般都有九个流程:

  1、16S相似度。

  2、形态学观察。

  比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等,还包括最适生长条件的确定。

  3、磷脂脂肪酸鉴定,这个具有属特异性。

  4、呼吸醌,也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种,这个有种特异性。

  5、分子杂交,也就是测定基因组序列,草图就行,然后跟近源物种去比较。

  相似度超过70%是一个种,低于70%是不同物种。

  6、碳源利用情况,看一下能利用哪些碳源

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